隐藏病毒出现在世界上最常用的onderzoeksplant

无数的研究结果可能受到最近描述plantenvirus

一种以前不为人知的病毒似乎出现在世界上研究最多的植物物种中, de zandraket (Arabidopsis thaliana). 该病毒的存在可能产生深远的影响研究. im体育官网app和瓦赫宁根大学的研究人员 & 研究了病毒在铁路上. In het vakblad New Phytologist 他们呼吁植物科学家测试他们的沙袋植物是否有病毒.

Zeer besmettelijk

为了弄清病毒如何影响植物, 研究人员做了各种实验. Planten die geïnfecteerd waren, 美白产品少了一些含有叶绿素并更好耐旱能力. 因为病毒进一步造成无明显症状, 研究人员发布了拟南芥的名字潜伏病毒1 (ArLV1).

研究人员发现,这种病毒很容易传播:40%的植物从种子的生长受感染的zandraket, 测试本身也积极的病毒. 研究人员还成功地将病毒从受感染的沙坑传播到健康的沙坑植物.

Vervuiling van datasets

但你如何发现病毒导致没有明显的症状? 当研究人员试图分析来自不同沙粒的RNA时,它浮出水面. rna病毒发挥除其他外,在蛋白质的生产过程中扮演了重要角色.

im体育-onderzoeker dr. Ava Verhoeven, 他几年前在瓦赫宁根曾在一个由病毒感染的RNA-dataset, 偶然发现im体育的数据集也有类似的问题. Verhoeven:“在这两个数据集中,超过90%的RNA样本不是沙克特的, maar van iets anders. 在瓦赫宁根是一个不知名的总RNA, RNA从大型数据库相比. 当时已经明显,应该是一个未知病毒的RNA. En toen we 来自im体育的数据集的未知的RNA病毒RNA来自瓦赫宁根相比, 看来,同样的未知病毒了.”

Dr. 与zandraketplanten Ava Verhoeven在实验室里
Dr. 与zandraketplanten Ava Verhoeven在实验室里. Foto: Laura Dijkhuizen.

Wereldwijd verspreid

瓦赫宁根的研究人员决定调查他们是否也能在其他研究人员在网上发布的数据集中发现病毒. 他们发现了RNA病毒的全部8,5%的数据集和可用zandraketlijnen近25%的不同, 什么表明病毒已经全球分布.

Veel werk en geld verspild

因此,Verhoeven确信病毒不仅在im体育和瓦赫宁根产生了不可用的数据集. “Zandraket是植物学Verhoeven)表示:“植物. “现在im体育的出版物是可用的, 许多研究人员识别数据集的问题. 他们之前只还不知道这种病毒于.”

“RNA-datasets planten-RNA很少,很容易被认为是失败. 结果通常不会发表的不同,所以没有在网上找到的其他研究人员. 就住病毒隐藏,尽管普遍. “感染”数据集的实际比例是所以可能远高于8,5 procent. 然后创建的数据集已经花费很多时间和金钱, 而你除几乎由病毒.”

Alle planten vooraf testen

由荷兰和西班牙的野生植物进行测试, 研究人员发现了这种病毒也在野外. 部分由于这个原因,这种病毒似乎已经在野外的沙袋植物中传播了很长一段时间,并最终进入了实验室. 因为许多研究人员zandraketzaden交换时,病毒容易传播.

Verhoeven和他的同事建议研究人员在创建大型数据集之前测试他们的沙袋种子是否存在病毒. Verhoeven:“当然,你想要防止你用来研究的植物中突然出现病毒. 不仅因为它使用的数据集可以带来, 但也因为病毒在未知的方式可以影响植物. 因此,im体育提供了一个协议,每个研究人员可以很容易地测试病毒是否存在于他们的植物中.”

Publicatie

拟南芥潜伏病毒1,a comovirus widely价差在 Arabidopsis thaliana collections

Ava Verhoeven, Karen J. Kloth, Anne Kupczok, Geert H. Oymans Janna Damen, Karin Rijnsburger, Zhang Jiang, Cas Deelen, Rashmi Sasidharan, Martijn van Zanten, René A. A. van der Vlugt

New Phytologist 2022年9月8日, http://doi.org/10.1111/nph.18466